O ataque de fungos dos gêneros Fusarium, Phytophthora, Pythium e Rhizoctonia na fase de germinação no viveiro causa lesão necrótica na região do colo da plântula murcha, enrolamento e secamento de cotilédones e, finalmente, o tombamento das mudas. O controle pode ser cultural, com o uso de sementes, substratos e água livre de patógenos; químico, com a aplicação de fungicidas; ou físico, com o tratamento do substrato com calor.