Segundo o Ministério da Saúde, são exemplos de instrumentos importantes de gestão e monitoramento de uma rede de pesquisa clínica que vem sendo adotados na RNPC: a criação de um comitê supervisor técnico, a elaboração de regimento interno, a produção de manuais técnicos, a criação de portal de comunicação, o intercâmbio entre os centros para elaboração de projetos de pesquisa multicêntricos e a definição de centros para liderar os processos de capacitação na rede.