O sistema aquífero Guarani está presente no Paraguai, no Uruguai, na Argentina e, no Brasil, nos estados de Goiás, Mato Grosso do Sul, Mato Grosso, Minas Gerais, São Paulo, Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Os aquíferos Serra Geral, Botucatu e Bauru compõem tal sistema no Brasil.