Os métodos de tratamento, também denominados de
métodos de fluidificação e descontaminação, são utilizados
para amostras clínicas com microbiota normal associada.
Eles são necessários para isolamento de micobactérias
em cultura, mas afetam em maior ou menor grau a viabilidade das micobactérias. O método recomendado para
amostras paucibacilares e o método recomendado para
amostras de escarro contaminadas com Pseudomonas
são, respectivamente: