As principais diferenças entre os ambientes na clareira e sob o dossel fechado incluem o aumento na luz e mudanças na sua qualidade; aumento da temperatura e disponibilidade de nutrientes vindos de plantas mortas decompostas. Essas mudanças no meio físico alteram a biocenose, pois mudas estabelecidas morrem devido à sensibilidade à luz, plantas de espécies pioneiras aparecem e outras maximizam o crescimento.