Entre os medicamentos antidepressivos, a amitriptilina é eficaz como tratamento profilático da enxaqueca, pois diminui a recaptação de serotonina na fenda sináptica, tendo uma ação antagonista dos receptores 5-hidroxitriptamina 2 (5-HT2) e 5-hidroxitriptamina 3 (5-HT3).