O SIAFI é o principal instrumento utilizado para registro, acompanhamento e controle da execução orçamentária, financeira e patrimonial do Governo Federal. Desde sua criação, o SIAFI tem alcançado satisfatoriamente seus principais objetivos (portal SIAFI), são eles:
I - Prover mecanismos adequados ao controle diário da execução orçamentária, financeira e patrimonial aos órgãos da Administração Pública; II - Fornecer meios para agilizar a programação financeira, otimizando a utilização dos recursos do Tesouro Nacional, através da unificação dos recursos de caixa do Governo Federal; III - Permitir que a contabilidade pública seja fonte segura e tempestiva de informações gerenciais destinadas a todos os níveis da Administração Pública Federal; IV - Padronizar métodos e rotinas de trabalho relativas à gestão dos recursos públicos, sem implicar rigidez ou restrição a essa atividade, uma vez que ele permanece sob total controle do ordenador de despesa de cada unidade gestora; V - Permitir o registro contábil dos balancetes dos estados e municípios e de suas supervisionadas; VI - Permitir o controle da dívida interna e externa, bem como o das transferências negociadas; VII - Integrar e compatibilizar as informações no âmbito do Governo Federal; VIII - Permitir o acompanhamento e a avaliação do uso dos recursos públicos; IX - Proporcionar a transparência dos gastos do Governo Federal.