Em sua estrutura, o SIAFI trata cada ano como um sistema diferente. Cada sistema, por sua vez, é
organizado em subsistemas, que podem ser organizados em cinco grupos, quais sejam:
A execução orçamentária e financeira, controle de haveres e obrigações, execução patrimonial, controle
físico de ativos imobilizados e gestão de recursos humanos.
B gestão de recursos humanos, organização de tabelas, administração contábil patrimonial, gestão
contábil orçamentária e recursos complementares com aplicação específica.
C controle de haveres e obrigações, administração do sistema, execução orçamentária e financeira,
organização de tabelas e recursos complementares com aplicação específica.
D controle físico de ativos imobilizados, gestão de recursos humanos, administração do sistema,
administração contábil patrimonial e gestão orçamentária.
E administração do sistema, administração contábil patrimonial, gestão contábil orçamentária, tabelas
de apoio e gestão de almoxarifado e recursos patrimoniais.