Um passo importante da clonagem é a seleção do
clone recombinante. Os Plasmídeos da série pUC possuem um gene (lacZ) que codifica a produção da enzima
β-galactosidase. A inserção do DNA exógeno (inserto)
no sítio de clonagem do plasmídeo causa a interrupção
do gene, levando à perda da função da β-galactosidase,
mudando a cor da colônia para branca. Assim as colônias
bacterianas são: