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O DNA é formado a partir de nucleotídeos trifosfato (ATP, GTP, CTP, TTP), que são unidos pela ligação fosfodiéster. Além de serem formadores do DNA, os nucleotídeos apresentam outras importantes funções nas células, podendo ser carreadores de energia, componentes de cofatores enzimáticos e mensageiros químicos (segundos mensageiros). A sequência de moléculas de/com nucleotídeos que participam das funções de carreador de energia, cofator enzimático e de segundo mensageiro, respectivamente, é: