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O tratamento da hipospádia visa reconstrução do pênis, com a criação de um meato uretral tópico e glande harmônica, retificação do pênis, uretra normal, redistribuição da pele e posição correta da bolsa escrotal em relação ao pênis. Seguindo as recomendações da Sociedade Brasileira de Urologia, considera-se a melhor época para realizar tal cirurgia: