O processo atualmente utilizado pelas indústrias produtoras de biodiesel, chama-se transesterificação. Neste processo, ésteres (triacilglicerídeos) de origem animal ou vegetal, normalmente com alta pureza, são reagidos com um monoálcool em excesso, de cadeia curta, na presença de catalisador, produzindo o biodiesel e o glicerol.