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A bacia hidrográfica do Juruá é uma das bacias com maior impacto ambiental na Amazônia, pois o uso hidroelétrico, a exploração de petróleo e gás, o garimpo e a expansão da fronteira agrícola nos três países que a integram — Peru, Colômbia e Brasil — afetam a biodiversidade e a preservação de sua fauna e flora.