A técnica de congelamento por jet-freezing apresenta algumas desvantagens, dependendo do tipo de amostra utilizada. Assi...

Não é ideal para células livres, uma vez que o propano é altamente tóxico, promovendo profundas alterações morfológicas nas células. Sua temperatura máxima de resfriamento é inferior à do nitrogênio líquido, por isso, é menos eficiente para o congelamento do que o nitrogênio líquido.

É ideal apenas para tecidos, uma vez que a área maior das amostras cria uma superfície de contato maior, o que distribui de forma igual o resfriamento tanto na superfície como em profundidade. O propano é um gás altamente volátil e, para mantê-lo no estado líquido, é necessário um ambiente de alto vácuo, o que torna o equipamento grande e caro, e o processo excessivamente demorado.

Não é própria para tecidos, uma vez que as microgotas de propano devem espalhar-se uniformemente em torno do material biológico, o que só é conseguido perfeitamente com as células livres. O propano apresenta características inflamáveis que tornam seu uso cauteloso, requerendo locais apropriados para esse fim.

É ideal apenas para amostras já pré-fixadas quimicamente, uma vez que o jato utilizado para o congelamento é focal e de baixa dispersão, congelando lentamente as amostras. Aplica-se apenas para tecidos: como o congelamento é focal, o tecido transfere a baixa temperatura para todas as suas regiões, proporcionando congelamento homogêneo principalmente por meio de sua profundidade.

A técnica é ideal apenas para tecido vegetal com espessura mínima de 50 μm: a parede celular presente nas células vegetais é um ótimo dispersante de temperatura. Dessa forma, o congelamento dá-se de forma homogênea em toda a profundidade do material. O propano é altamente tóxico para as células vivas; por isso, o material deverá ser fixado quimicamente antes de submetido a essa técnica de congelamento.