A citoquímica ultraestrutural

se baseia no uso de lecitinas acopladas a ouro coloidal, o que permite a marcação e a localização da maioria das moléculas biológicas presentes nas amostras. Essa técnica é restrita a análise pelo microscópio eletrônico de transmissão.

explora as similaridades entre as propriedades químicas das moléculas biológicas por meio do uso de marcadores eletrondensos. Essa abordagem é capaz de detectar simultaneamente diversos grupos de moléculas nas amostras analisadas; no entanto, essa técnica restringe a análise do material à MEV.

explora as diferentes propriedades químicas das moléculas biológicas, ou suas particulares atividades, por meio do uso de marcadores eletrondensos ou granulosos que podem se associar às próprias moléculas ou aos seus produtos, de forma a revelar a sua localização na amostra analisada. Essa técnica é visível na microscopia eletrônica.

utiliza a afinidade entre as moléculas de biotina e avidina para a identificação exclusiva de material genético. Nessa técnica, é possível marcar tanto moléculas de DNA quanto moléculas de RNA mensageiro; no entanto, não é possível identificar moléculas de RNA transportador devido a seu dobramento específico.

explora as semelhanças entre as moléculas de lipídios, ou seja, sua hidrofobicidade, para, dessa forma, localizá-la na amostra. A técnica produz um precipitado insolúvel e eletrolucente, de forma a facilitar a observação e a localização dos lipídios nas amostras biológicas.