Os equipamentos de estereotaxia modernos foram inspirados nos dispositivos para uso em pesquisa com animais. Aubrey Muss...

Leksell e Backlund, em Estocolmo, e Riechert e Mundinger, em Freiburg, utilizaram seus talentos para desenvolver o equipamento estereotáxico necessário, e realizaram as primeiras biópsias estereotáxicas da era moderna.

Nos primeiros anos da estereotaxia no homem, um mapa estereotáxico da anatomia do cérebro humano não estava disponível, até que o primeiro atlas do cérebro humano para cirurgia estereotáxica foi editado por Spiegel e Wycis, em 1952, no qual a comissura anterior foi usada como um único ponto de referência intracerebral em combinação com várias referências cranianas externas.

A ligação entre a cirurgia experimental e a humana estereotáxica foi incentivada pelos neurologistas que estudaram os efeitos de diferentes ablações e destruições de partes do cérebro para aliviar síndromes que, naquele momento, não dispunham de qualquer forma de tratamento.

O conceito de estereotaxia de Horsley-Clarke foi aplicado pela primeira vez em equipamento utilizado para eletroencefalografia em profundidade por Robert Hayne e Frederic Gibbs, em 1947. A relação assumida entre marcos externos e estruturas intracranianas forneceu inicialmente a localização do alvo, e pneumoencefalografia confirmou a posição do eletrodo em profundidade.

O trabalho de Hayne e Gibbs, paralelamente aos esforços de Ernest A. Spiegel e Henry T. Wycis, conduziram ao desenvolvimento de equipamentos estereotáxicos e sua subsequente utilização em seres humanos para o tratamento de dor crônica, da epilepsia, de distúrbios do movimento e para a psicocirurgia.