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O reprocessamento adequado dos endoscópios flexíveis e dos respectivos acessórios é parte essencial do programa de segurança e de garantia da qualidade em endoscopia digestiva. O material endoscópico tem algumas particularidades que dificultam a sua descontaminação, nomeadamente fatores relacionados com a presença de ângulos agudos, juntas, superfícies fechadas inacessíveis e mecanismos diversos, o número e tipo de canais, o seu comprimento e flexibilidade, a composição com materiais de várias características, e a termossensibilidade. As Unidades de Endoscopia Digestiva na promoção de boas práticas para a melhoria contínua da qualidade e da segurança nos cuidados, devem seguir algumas recomendações. Em sua Secção 1 diz: