O único esterilizante químico autorizado é o ácido peracético a 3%, devendo ser utilizado com imersão total por 2 a 4 horas. Além de ser observado o prazo de validade, devem ser observadas as condições do produto, com rediluição e presença de sujidade. A esterilização química deve ser utilizada somente para produtos termossensíveis, como artigos de acrílico, plástico, nylon, tubos de borracha e silicone, que não resistem em autoclave.